Mycobacterium tuberculosis complex en niet-tuberculeuze mycobacteriën detectie met behulp van PCR

Welke test wordt uitgevoerd?

• Voor verdenking van tuberculosis -complex infectie
  • Voor pulmonaire monsters, CSF en niet-pulmonaire monsters met sterke verdenking van rifampicine-resistente tbc: GeneXpert MTB/RIF Ultra.
  • Voor niet-pulmonaire monsters (behalve CSF) zonder verdenking van rifampicine-resistente TB: DNA-extractie gevolgd door een in-huis qPCR gebaseerd op IS6110/16SrRNA gen.
• Voor verdenking van leprae infectie: RLEP-qPCR & RLPM-qPCR
• Voor verdenking van ulcerans infectie: IS2404-qPCR.
• Voor verdenking van andere atypische (niet-tuberculeuze) mycobacteriën (NTM): PCR gebaseerd op 16SrRNA gen.
  • Verdere identificatie van het species via sequentiebepaling van een positieve PCR.

Afname-instructies

• Mogelijk op sputum, bronchiale lavage, bronchiaal aspiraat, CSF, etter, maagvocht, lumbaalvocht, punctievocht. Een minimum volume van 1 ml is aanbevolen.
• Biopsies dienen op steriele wijze te worden afgenomen en droog te worden verstuurd. In geval van een gecombineerde onderzoek met Leishmania moet het biopt onmiddellijk na afname in 1ml steriel fysiologisch water worden geplaatst voor transport.
• Mogelijk op urine. Een minimum volume van 2 ml is aanbevolen.
• PCR analyses worden niet uitgevoerd vanaf formaline-behandelde monsters/ paraffine blokjes.

Toegeleverde DNA-extracten bij voorkeur aanleveren met toevoeging van negatieve DNA-extractie controle van dezelfde extractierun.

Bewaarcondities

De monsters of DNA-extracten worden in de koelkast (2-8°C) bewaard.
De monsters of DNA-extracten worden verstuurd op kamertemperatuur.

Monsters moeten zonder additieven worden bewaard en verstuurd, of met steriel fysiologisch water bij een gecombineerde onderzoek met Leishmania.

Belangrijke raadgevingen en opmerkingen

GeneXpert MTB/RIF Ultra laat ook toe om resistentie aan rifampicine te bepalen.

Verdenking van atypische mycobacteriën (NTM) moet specifiek vermeld worden. GeneXpert MTB/RIF Ultra laat niet toe om NTM te detecteren en er blijft geen resterend monster over voor verdere analyses.

Verdenking van M. leprae of M. ulcerans moet specifiek vermeld worden bij aanvraag.

Als u ook een kweek wenst, mogen de monsters niet ouder zijn dan 7 dagen. Bijkomende kweek is enkel mogelijk indien voldoende monster wordt aangeleverd.

Gelieve te vermelden of art. 24 bis van toepassing is. Indien niet aan deze voorwaarden voldaan is, wordt de analyse enkel uitgevoerd indien de aanvraag vergezeld is van een degelijke motivatie.

Detectielimiet:

• GeneXpert MTB/RIF Ultra: 16 CFU/ml (experimenteel geïnfecteerde sputum monsters) of 10-100 CFU/mL (geconcentreerde monsters)
• In-huis IS6110 qPCR: 100 bacillen/200µl staal.
• RLEP-qPCR: 30 copies/2µL DNA-extract
• IS2404-qPCR: 100 bacillen/200µl staal